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francois |
979 |
#include "poly_voro.h" |
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#include "poly_point.h" |
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#include "poly_noeud.h" |
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#include "poly_face.h" |
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#include "poly_cellule.h" |
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#include <iostream> |
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#include <algorithm> |
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#include "../voro++-0.4.6/src/voro++.hh" |
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Poly_Voro::Poly_Voro(std::vector<Poly_Point*> list_pnts): list_points(list_pnts) |
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{ |
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// Géométrie du conteneur |
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double x_min= list_points[0]->get_x(), x_max= list_points[6]->get_x(); |
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double y_min= list_points[0]->get_y(), y_max= list_points[6]->get_y(); |
| 17 |
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double z_min= list_points[0]->get_z(), z_max= list_points[6]->get_z(); |
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double cvol = (x_max - x_min) * (y_max - y_min) * (x_max - x_min); |
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// Nombre de blocs qui divise le container (blocs calculatoires) |
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int n_x= 6, n_y= 6, n_z= 6; |
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// Cré un container avec la géométrie données |
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voro::container con(x_min, x_max, y_min, y_max, z_min, z_max, n_x, n_y, n_z, false, false, false, 8); |
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// Ajoute les particules au container, on n'insère pas les 8 coins du cube |
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double x,y,z; |
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for(int i=8; i < list_points.size(); i++) { |
| 29 |
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x = list_points[i]->get_x(); |
| 30 |
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y = list_points[i]->get_y(); |
| 31 |
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|
z = list_points[i]->get_z(); |
| 32 |
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|
con.put(i, x, y, z); |
| 33 |
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|
} |
| 34 |
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// Additionne les volumes et vérifi que ça concorde avec le volume du container |
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double vvol = con.sum_cell_volumes(); |
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std::cout << "Container volume: " << cvol << std::endl; |
| 38 |
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std::cout << "Voronoi volume: " << vvol << std::endl; |
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std::cout << "Difference: " << vvol-cvol << std::endl; |
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| 41 |
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voro::voronoicell voro_cell; |
| 42 |
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voro::c_loop_all loop(con); |
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// loop a travers les cellules |
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if(loop.start()) do if(con.compute_cell(voro_cell,loop)) |
| 46 |
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{ |
| 47 |
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|
Poly_Cellule* cell = new Poly_Cellule; |
| 48 |
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add_cell(cell); |
| 49 |
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loop.pos(x,y,z); // position globale de la particule en cours |
| 50 |
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| 51 |
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// récupération des noeuds |
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std::vector< double > vert_xyz; |
| 53 |
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voro_cell.vertices(x, y, z, vert_xyz); // récupère tous les vertex de la cellule dans le système global |
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| 55 |
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for(int i=0; i < vert_xyz.size(); i+=3) |
| 56 |
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{ |
| 57 |
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|
Poly_Noeud* nd = new Poly_Noeud(i, vert_xyz[i], vert_xyz[i+1], vert_xyz[i+2]); |
| 58 |
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|
cell->add_noeud(nd); |
| 59 |
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|
} |
| 60 |
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| 61 |
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// récupération des faces |
| 62 |
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std::vector< int > face_vert; |
| 63 |
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voro_cell.face_vertices(face_vert); // liste de vertex pour chaque face |
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| 65 |
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for(int i=0; i < face_vert.size(); i++) |
| 66 |
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{ |
| 67 |
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|
Poly_Face* face = new Poly_Face; |
| 68 |
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|
int nbVert = face_vert[i]; // première valeur = le nombre de vertex de la face |
| 69 |
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|
for(int j=i+1; j < i+nbVert+1; j++) |
| 70 |
|
|
{ |
| 71 |
|
|
face->add_noeud(face_vert[j]); |
| 72 |
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|
} |
| 73 |
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|
cell->add_face(face); |
| 74 |
|
|
i += nbVert; |
| 75 |
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|
} |
| 76 |
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|
} while (loop.inc()); |
| 77 |
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|
} |
| 78 |
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// destructor |
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Poly_Voro::~Poly_Voro() |
| 81 |
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{ |
| 82 |
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for (int i=0; i<get_nb_cell(); i++) |
| 83 |
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{ |
| 84 |
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|
Poly_Cellule* c = list_cellules[i]; |
| 85 |
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|
delete c; |
| 86 |
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|
} |
| 87 |
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} |
| 88 |
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void Poly_Voro::fusion_noeuds(void) |
| 90 |
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{ |
| 91 |
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double eps = 10e-17; |
| 92 |
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| 93 |
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// cré une liste contenant {(x, y, z), (num_cellule, num_noeud)} |
| 94 |
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std::vector< std::pair< std::vector<double>, std::vector<int> > > list_noeud; |
| 95 |
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| 96 |
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for(int i=0; i < get_nb_cell(); i++) |
| 97 |
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{ |
| 98 |
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|
Poly_Cellule* c = get_cell(i); |
| 99 |
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|
for(int j=0; j < c->get_nb_noeud(); j++) |
| 100 |
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|
{ |
| 101 |
|
|
double x = c->get_noeud(j)->get_x(); |
| 102 |
|
|
double y = c->get_noeud(j)->get_y(); |
| 103 |
|
|
double z = c->get_noeud(j)->get_z(); |
| 104 |
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|
std::vector<double> coord = {x, y, z}; |
| 105 |
|
|
std::vector<int> id = {i, j}; |
| 106 |
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|
list_noeud.push_back(std::make_pair(coord,id)); |
| 107 |
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|
} |
| 108 |
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|
} |
| 109 |
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| 110 |
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// sort les noeud dans l'ordre croissant de leur coordonnée |
| 111 |
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|
std::sort(list_noeud.begin(), list_noeud.end()); |
| 112 |
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|
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| 113 |
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|
// comparaison de la distance entre un noeud et le suivant |
| 114 |
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|
for(int i=0; i < list_noeud.size()-1; i++) |
| 115 |
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|
{ |
| 116 |
|
|
Poly_Noeud* curr = get_cell(list_noeud[i].second[0])->get_noeud(list_noeud[i].second[1]); |
| 117 |
|
|
Poly_Noeud* next = get_cell(list_noeud[i+1].second[0])->get_noeud(list_noeud[i+1].second[1]); |
| 118 |
|
|
|
| 119 |
|
|
double dist_x = fabs(curr->get_x() - next->get_x()); |
| 120 |
|
|
double dist_y = fabs(curr->get_y() - next->get_y()); |
| 121 |
|
|
double dist_z = fabs(curr->get_z() - next->get_z()); |
| 122 |
|
|
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| 123 |
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|
if(dist_x < eps && dist_y < eps && dist_z < eps) |
| 124 |
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|
{ |
| 125 |
|
|
// le noeud est le même, donc on égale la coordonnée |
| 126 |
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|
next->set_x(curr->get_x()); |
| 127 |
|
|
next->set_y(curr->get_y()); |
| 128 |
|
|
next->set_z(curr->get_z()); |
| 129 |
|
|
} |
| 130 |
|
|
} |
| 131 |
|
|
} |
| 132 |
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| 133 |
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| 134 |
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|
// |
| 135 |
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// Accessor et modifier |
| 136 |
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|
// |
| 137 |
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| 138 |
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void Poly_Voro::add_cell(Poly_Cellule* element) |
| 139 |
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|
{ |
| 140 |
|
|
list_cellules.push_back(element); |
| 141 |
|
|
} |
| 142 |
|
|
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| 143 |
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|
Poly_Point* Poly_Voro::get_point(int num) |
| 144 |
|
|
{ |
| 145 |
|
|
return list_points[num]; |
| 146 |
|
|
} |
| 147 |
|
|
|
| 148 |
|
|
Poly_Cellule* Poly_Voro::get_cell(int num) |
| 149 |
|
|
{ |
| 150 |
|
|
return list_cellules[num]; |
| 151 |
|
|
} |
| 152 |
|
|
|
| 153 |
|
|
int Poly_Voro::get_nb_cell(void) |
| 154 |
|
|
{ |
| 155 |
|
|
return list_cellules.size(); |
| 156 |
|
|
} |
